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糖基化改造β-葡萄糖醛酸苷酶的热稳定性

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第66卷第9期 2015年9月 Hu 化工 学报 、,01.66 No.9  CIESC JoumalSeptember 2015 一研一 一究~ 一论一 一文一 糖基化改造 一葡萄糖醛酸苷酶的热稳定性 王小艳 ,樊艳爽 ,韩蓓佳 ,冯旭东 ,李春 , ( 天津大学化工学院,天津300072; 北京理工大学生命学院,北京100081) 摘要:以Ⅳ-糖基化提高毕赤酵母重组表达B.葡萄糖醛酸苷酶(PGUS.P)的热稳定性为目的,在PGUS.P模拟结 构分析的基础上,半理性方法设计并通过定点突变引入具有EAS(enhanced aromatic sequence)序列特征的新Ⅳ_ 糖基化位点,经毕赤酵母重组表达后,获得了3个新糖基化的突变酶PGUS.P.26、PGUS.P一35和PGUS.P.259。 反应动力学分析表明,与原始PGUS-P相比,突变酶PGUS.P.26、PGUS.P.35和PGUS.P.259催化甘草酸水解的 ,m变小, , 。增加,表明其对底物甘草酸的亲和力和催化效率均得到提高。热稳定性分析表明,PGUS.P.35 和PGUS—P.259的热稳定性得到改善,在65 ̄C下保温90 min,其热稳定性相对PGUS.P分别提高了13% ̄E 11%。 研究表明在蛋白质的合适位点引入糖基修饰对提高蛋白的热稳定性具有促进作用。 关键词:Ⅳ_糖基化;B 葡萄糖醛酸苷酶;热稳定性;分子模拟;动力学 DOI:10.1 1949 ̄.issn.0438—1 157.20150885 中图分类号:Q 816 文献标志码:A 文章编号:O438—1157(2015)09—3669—09 Improvement of thermostability of recombinant ̄-glucuronidase by glycosylation WANG Xiaoyan ,FAN Yanshuang2HAN Beijia ,FENG Xudong2,LI Chun 。 ,(1School ofChemical Engineering and Technology,Tianjin University,Tianjin 300072,China; School oft@Science,BeijingInstitute ofTechnology,Beijing 100081,China) Abstract:To improve the thermostability of recombinant 13-glucuronidase expressed in Pichia pastoris(PGUS—P、 by N-glycosylation,new N-glycosylation sites were semi—rationally designed according to the simulated structure of PGUS—P.Three new N-glycosylation sites with EAS(enhanced aromatic sequence)were introduced by site-speciifc mutagenesis.After expression in Pichia pastoris,three mutant enzymes with new N-glycosylation were obtained,named as PGUS—P一26,PGUS—P一35 and PGUS—P一259.The kinetic analysis indicated that ax of PGUS.P.35 was improved from 1 1 1.25 gmol・(L・min)。。to 120.48 gmol・(L・min)一 and all ofthe three mutant enzymes showed a greater afinifty and catalytic eficifency towards substrate glycyrrhizin compared to PGUS—E The thermostabiliy ofPGUS—P-t35 and PGUS—P一259 at 65 ̄C increased by 13%and 11%compared with that of PGUS一 respectively.This study demonstrated that the introduction of N-glycosylation at the suitable region of enzyme could increase its thermostabiliy.t Key words:N-glycosylation;13-glucuronidase;thermostability;molecular simulation;kinetics 2015.06—10收到初稿,2015.06—17收到修改稿。 Received date:20l5-06.10. 联系人:李春。第一作者:王小艳(198O一),女,博士研究生。 基金项目:国家自然科学基金项目(21376028,21176028 21425624);教育部博士点基金项目(20121101110050)。 C0rresp0nding author:Prof.LI Chun,lichun@bit.edu.an Foundation item:supposed by the National Natural Science Foundation of China(21376028,21176028,21425624)and the Doctoral Fund of the Ministry ofEducation ofChina(20121101110050). ・3670・ 化工学报 第66卷 引 言 大量研究表明糖基化是调节酶活性和稳定性 的关键因素,可以赋予许多蛋白质有益属性和功 糖基修饰和糖蛋白之间关系的研究,发现将Ⅳ_糖链 引入蛋白质适当的二级结构中能增加其结构稳定 性。因此通过定点突变来减少或增加糖基化位点, 对探索Ⅳ_糖基化对全局糖蛋白的影响是一种有效 手段。 B.葡萄糖醛酸苷酶(GUS,EC 3.2.1-31)属于 糖苷酶,大部分属于糖基水解酶第二家族,它能催 化各种类型的B一葡萄糖醛酸苷水解产生多种衍生物 同时释放出6.葡萄糖醛酸 引。相关研究表明,该酶 能 4。。蛋白质经糖基修饰后能避免热力学降解,提 高其热稳定性,而天然糖基化蛋白质的糖基侧链的 去除会降低其热力学稳定性,从而增加蛋白质聚集 的可能性L5 J。例如,糖基化在维持组织蛋白酶E 稳定性中发挥重要作用,潜在糖基化位点的去除导 致了组织蛋白酶E对热和酸稳定性的下降 』。 可以转化甘草酸(GL)生成单葡萄糖醛酸甘草次酸 Fonseca.M ̄donado等 ]发现,毕赤酵母中重组表达 (GAMG)[14-18],且与GL相比,GAMG具有极性 的糖基修饰的木聚糖酶与大肠杆菌中表达的未发生 适中、安全性更高及生物利用度更高等优点,更能 糖基化的对照酶相比热稳定性得到显著提高。研究 满足工业生产应用的需求。前期将来自Penicillium 表明,糖基化可提高弹性蛋白酶rPAEd在有机溶剂 purpurogenum Li一3菌中的B.葡萄糖醛酸苷酶在毕赤 中的稳定性,使其在70 ̄C时的半衰期延长至32.2 酵母中重组表达后发现其发生了糖基修饰,而经糖 min,与未糖基化的对照(23.1 min)相比热稳定性 基修饰后的6一葡萄糖醛酸苷酶(PGUS—P)的热稳 有了显著改善 ]。另外,由于糖链自身的亲水性, 定性与野生型相比得到明显提高【】 。 经过糖基化修饰后蛋白质的水溶性可能会发生变 考虑到糖基化对糖蛋白热稳定性的显著影响, 化,有利于一些糖蛋白的分泌【9J。由于糖基化具有 本研究以PGUS.P为研究对象,基于结构模拟对其 赋予蛋白质有益特性和功能的潜力,近年来糖基化 进行半理性设计,通过定点突变技术在该酶的氨基 在蛋白质改造方面得到越来越广泛的关注。 酸序列中引入具有EAS序列的新Ⅳ-糖基化位点, 真核生物中Ⅳ-糖基化识别位点主要有N.x—T 并对突变酶进行活性检测和糖基化验证,同时对突 和N—x.S两种形式,研究发现N.X—T结构比N—x.S 变酶的催化特性和热稳定性进行分析,以期得到含 结构更容易被糖基化ll…。但很多自然界蛋白质存在 有不同位点糖基化的热稳定性提高的B.葡萄糖醛酸 自身含有的潜在糖基化位点并未被糖基修饰的现 苷酶,同时也为将来对其他工业用酶稳定性的改造 象,有研究表明,位于蛋白结构反向转角区上的糖 提供一种新思路和理论基础。 基化位点天冬酰胺前面2~3个位置的氨基酸为苯 丙氨酸时,有利于芳香族侧链和糖链的Ⅳ_乙酰葡糖 1实验材料与方法 胺相互作用,从而提高糖基化效率,该特征氨基酸 1.1菌株与质粒 序列主要有3种形式:F.N.x—T、F—x-N.x—T和 表达宿主毕赤酵母Ppastoris GS l 1 5和大肠杆 F—x.x.N.x—T,具有该特征的序列被称为EAS 菌BL21(DE3)Star为本实验室自行保藏。用于分 (enhanced aromatic sequon)序ydt11-12]。而随着对 子克隆实验的克隆宿主为(E.coli)Topl0购自博迈 n (b) 图1质粒示意图 Fig.1 Schematic diagram ofplasmid (a)pGAPZ-Pgus-ungly;(b)pET28a-Pgus—ungly 第9期 王小艳等:糖基化改造B一葡萄糖醛酸苷酶的热稳定性 ・3671・ 德公司,毕赤酵母和大肠杆菌的表达质粒模板为潜 在糖基化位点突变了的pGAPZ・Be,us-ungly和 pET28a-PgUS—ungly(图1),为实验室自行构建保存。 1.2酶和试剂 PCR相关试剂如rTaq DNA聚合酶等购自 蛋白上样缓冲液重悬,在沸水浴中煮沸5 min后离 心后取上清电泳;制胶,参考说明书配制10%的分 离胶和5%的浓缩胶;电泳:初始电压控制在80 v, 等样品泳过浓缩胶后将电压调节到120 V直至电泳 结束;染色和脱色:将凝胶剥下后用考马斯亮蓝 R250染色液染色1 h,然后用脱色液脱色,期间换 脱色液1~2次,脱色充分后拍照保存。 TaKaRa公司;凝胶回收试剂盒和质粒提取试剂盒 购自北京博迈德科技发展有限公司;性内切酶, 如 I、DpnI等购白TaKaRa公司。 l-3微生物的培养 大肠杆菌的培养:采用LB培养基,37 ̄C,摇 床转速170 r・min- 时培养12 h。 毕赤酵母Ppastoris GS115的培养:采用YPD 培养基,30℃,摇床转速170 r・min_ ,培养3 d。 1.4定点突变 ①以质粒为模板,利用表1中的引物克隆整个 质粒,同时在目标基因上引入突变位点; ̄PCR产 物可直接利用Dpn I消化甲基化或半甲基化的模 板;③将酶切产物直接转化到大肠杆菌Topl0感受 态细胞中;④筛选到阳性克隆、测序正确后将质粒 在表达宿主中表达。 表1引物序列表 Table 1 Primers sequence table 26 F 5 .CATCCTTCGACAACAATACGCAACC-3 R 5’.TATTGTTGTcGAAGGATGCTAGGGC-3 35 F 5'-ACCATGGACATTCCAAAATAAAACGTCC.3 R 5'-ACGTTTTATTTTGGAATGTCCATGGTTG.3 259 F 5'-CATAGACTTCTCCAACAAGACTATTGATAC.3 R 5 .CAATAGTCTTGTTGGAGAAGTCTATGATG一3 1.5突变酶的表达 大肠杆菌的表达体系构建与突变酶的表达参 照Merck Novagen的pET表达系统说明书。 毕赤酵母Ppastoris GS115的表达体系构建与 突变酶的表达根据Invitrogen公司pGAPZ表达载体 操作手册进行操作。 1.6重组蛋白的纯化及SDS.PAGE分析 大肠杆菌表达蛋白的纯化采用Ni Fast Flow镍 柱亲和色谱柱进行;毕赤酵母表达蛋白的纯化采用 Q Sepharose Fast Flow强阴离子交换柱进行;蛋白 质的丙酮沉淀,向培养基中加入等体积的预冷的丙 酮,轻轻混匀后,4℃,12000 r・min- 离心10min, 收集蛋白沉淀,最后加入适量的缓冲液溶解蛋白。 SDS.PAGE分析,样品处理:取样品4O 加入10 1 1.7糖蛋白PAS染色 PAS(periodic acid—Schiff's base method)染色 方法:利用品红的高碘酸.希夫试剂,通过对糖链染 色来检测糖蛋白的存在。取出SDS—PAGE后的凝 胶,将其在10%冰醋酸一35%甲醇溶液中浸泡1~2 h 以固定蛋白条带;然后将固定后的凝胶取出用5% 的冰醋酸清洗2次,每次10 miar然后把凝胶浸泡 在用5%冰醋酸配制的1%的高碘酸溶液中,在4 ̄C 中黑暗条件下氧化1 h:用5%冰醋酸将凝胶漂洗几 次后,用50 ml的偏重亚硫酸钠溶液(0.2 g偏重亚 硫酸钠溶于100 ml 5%冰醋酸)浸泡10 min;用 Schiff试剂于4℃避光染色1 h;染色完毕后将凝胶 用大量5%冰醋酸进行清洗,即可见红色糖蛋白电 泳条带。 1.8糖蛋白糖苷酶F酶法 糖苷酶F酶切条件如下:①2O g糖蛋白在1 ×糖蛋白变性缓冲液中,100℃煮沸10 min,使糖 蛋白变性。②加入1/10体积的10×G7缓冲液及10% NP一40。⑧加入1~5 ulPNaseF,37℃温育1 h,将 酶切后样品进行SDS.PAGE检测。 1.9 B.葡萄糖醛酸苷酶的活性测定 以硝基苯一葡萄糖醛酸苷(P—NPG)为底物的 酶活测定:取10 l酶液加40 l P—NPG(1.25 mmol・L )最适温度下反应10min后,加入200gl、 0.4 mol・L 的碳酸钠终止反应,用酶标仪(405 nm) 检测样品溶液中对硝基苯酚的含量。B一葡萄糖醛酸 苷酶活力定义:一个活力单位(U)为上述条件下, 每分钟催化生成1 gmol对硝基苯酚所需的酶量。 以甘草为底物的酶活测定:取100 gl酶液与 400 ul甘草酸缓冲溶液反应,一定温度下反应一段 时间后,沸水浴处理10 min使酶失活,样品与甲醇 的混合比例为1:9,用HPLC检测GL、GAMG和 GA的含量。采用高效液相色谱外标法对甘草酸、 GAMG和甘草次酸进行测定,仪器设置参数为: 岛津LC一10A,色谱柱:Shim.pack,VP—ODS,检 测器:SPD,检测波长:254nm,流动相:甲醇:0.6% 乙酸=81:19,进样量:10 u1,流速:1 ml・min~, ・3674・ 化工学报 第66卷 一 图6糖苷酶F处理前后SDS—PAGE电泳图 Fig.6 SDS.PAGE analysis ofmutant enzymes treated 一一 一 l+ PNGaseF  图7毕赤酵母表达突变酶的比酶活测定 Fig.7 Specific activity analysis of mutant enzymes expressed in P pastoris with/without PNGase F denoted untreated by PNGase F:+denoted treated by l+ 生了变化。酶切前大小与自身含有糖基化的PGUS—P 一利用HPLC分析考察了突变酶水解甘草酸模式 (催化特异性)有无发生变化,图8显示了各突变 酶水解甘草酸反应的结果。甘草酸(GL)为底物, 产物为单葡萄糖醛酸基甘草次酸(GAMG)和甘草 次酸(GA),三者的保留时间分别为5.2 min,1 1.6 min和21-3 min[24]。从图8的结果可以看出, PGUS—P一26、PGUS.P 35和PGUS.P一259对甘草酸 致,而酶切后大小则与无糖基化的PGUS.E大小 保持一致,糖苷酶F酶切结果表明3个突变酶均发 生了糖基修饰。 2-3突变酶的催化特性分析 为检测获得的突变酶是否具有活性,对纯化得 到的突变酶样品进行了以P.NPG为底物的酶活检 查,如图7所示,发现不同糖基化位点比酶活呈现 较大差异。PGUS.P.35的比酶活为141.5 U・mg~, 明显高于对照PGUS—P的106.1 U・mg- , 的水解模式均未发生变化,与对照PGUS.P一样生成 GAMG和GA两种产物。表明不同位点糖基化修饰 不会改变B.葡萄糖醛酸苷酶的催化反应类型。该结 PGUS—P一259与PGus—P相比也有所提高,为125.5 U・mg~,而PGUS.P一26的比酶活却下降为60.07 U・mg~。此种现象可能与发生糖基化的位点不同 有关系,PGUS.P.26的突变位点的糖基修饰可能影 响到了酶的正常活性导致其比酶活下降。Miller等曾 报道过当把endothelial lipase(EL)的N373、N449 和N471位的糖链去除后,EL的酶活降低了70%,但 去除N62位的糖链,EL的酶活反而提高了5倍[22-23], 也说明了不同糖基化位点对酶活的影响不同。 论与江南大学余晓斌课题组报道的Ⅳ-糖基化对弹 性蛋白酶的底物特异性没有显著影响是一致的【5J。 大多数情况下,发生了Ⅳ_糖基化的蛋白质的催化 特性要优于与其对应的没有被糖基修饰的蛋白,尽管 有时候糖基修饰并未引起蛋白结构的显著改变【2引。 糖链的添加可能通过影响酶蛋白环状结构域与催化 残基的相互作用来影响酶与底物之间的亲和力【26J。 为了考察新引入糖基修饰的突变酶在实际催化反应 体系中的催化性质,采用Lineweaver-Burk双倒数 > g 》 time/min 图8 突变酶水解甘草酸(GL)的模式 Fig.8 Hydrolysis ofglycyrrhizin by mutant enzymes 第9期 王小艳等:糖基化改造B-葡萄糖醛酸苷酶的热稳定性 ・3675・ 作图法计算酶反应动力学常数( , , 砒, ,m),结果如表3所示。PGUS.P.35的最大反应 速率 与PGUS.P相比得到提高,为120.48 gmol・(L・min)~。三者的 和 at与PGUS—P相 比均减小,说明新引入的糖基化不同程度地提高了 B.葡萄糖醛酸苷酶与甘草酸底物的亲和力,可能是 糖基修饰使得酶蛋白空间构象更有利于底物的结 合,而且3株突变酶PGUS.P一26、PGUS—P一35和 PGUS—P一259的 at/ 与PGUS—P相比分别提高了 30.1%,23.9%和12.6%,表明其催化底物甘草酸的 效率同时也得到提高。 2.4突变酶热稳定性分析 大量研究表明,Ⅳ_糖基化可以提高蛋白的稳定 性,其原因主要有两个:一是糖链的形成可以降低 未折叠蛋白的无序度,即提高了一些未折叠的糖蛋 白的稳定性;二是由于糖链本身是一些分子量较大 的亲水基团,会增加蛋白的可溶性并且有利于抑制 蛋白聚集体的形成【2 。另外,也有研究表明,虽然 有时候一些糖蛋白的糖基化并没有显著改变蛋白的 二级结构,但会减缓其热失活过程,一定程度上抑 制了热变性过程中蛋白的聚集【2引,这也进一步证明 了糖基化可提高蛋白稳定性。为验证不同位点新引 入的Ⅳ_糖基化对B一葡萄糖醛酸苷酶热稳定性的影 响,首先在大肠杆菌中表达了相应的含有这3个突 变序列的B一葡萄糖醛酸苷酶,分别命名为 PGUS.E.26、PGUS—E一35和PGUS.E.259,然后同 时考察了有糖基修饰的PGUS—P.26、PGUS—P一35和 PGUS.P.259和无糖基修饰的PGUS.E.26、 PGUS—E一35和PGUS.E一259在65℃时的热稳定性。 将酶液置于65℃水浴中,每隔30 min时间间隔取 样,测定酶活,以保温前的酶活为对照并记为l00%, 测定结果如图9所示。 在65℃保温时,糖基化突变酶PGUS.P.35和 PGUS—P.259的热稳定性与对照PGUS—P相比得到 提高。65℃保温90 min时,二者剩余酶活力分别维 持在95%和93%,而PGUS—P剩余酶活为84%左右。 但PGUS—P.26在65℃保温90 min时的剩余酶活仅 为74%左右。继续延长保温时间可以发现, PGUS.P.35,PGUS.P.259两突变体的剩余酶活下降 非常缓慢,3 h后仍然保留高达85%以上的剩余酶 活,而PGUS.P只保留70%以上的酶活。且糖基化 系统中表达的PGUS.P一26,PGUS—P一35和 PGUS.P一259热稳定性均显著高于非糖基化系统中 的表达的相应酶,上述结果表明糖基修饰提高了该 酶的热稳定性。 此外,从图9(a)可以看出,PGUS—E.26与其 对照PGUS.E相比提高约10%,表明该位点的氨基 酸突变有利于热稳定性的提高,但糖基修饰的 PGUS.P.26的热稳定性却低于对照PGUS.P,原因 可能是该位点的糖基修饰影响了酶的局部结构导致 其稳定性降低。而PGUS—E一35和PGUS.E.259的热 稳定性与PGUS—E相比并未有显著变化趋势『图9 (b),(c)1,说明相应位点的氨基酸突变对稳定性 影响不大,但糖基修饰的PGUS.P.35和PGUS—P一259 热稳定性与对照PGUS.P相比明显提高,进一步说 明二者的热稳定性提高确实是由引入的糖基化引起 的。上述结果表明糖基化对B一葡萄糖醛酸苷酶的热 稳定性有显著影响,且不同位点的糖基化对该酶的 影响有明显差异,这与文献中报道的不同位点上的 糖基化对酶具有明显不同影响的结论是一致的『8]。 3 结 论 本研究以糖基修饰作为一种新的酶稳定性改 造手段,以毕赤酵母重组表达PGUS—P为研究对象, 在对PGUS.P结构模拟的基础上,采用半理性设计 方法对其进行糖基改性,利用定点突变方法在B一葡 萄糖醛酸苷酶氨基酸序列中引入3个具有EAS序列 的新Ⅳ_糖基化位点,经活性检测和PAS染色及糖苷 酶F酶切分析,获得了糖基修饰的突变酶PGUS-P.26、 PGUS.P一35、PGUS—P一259。研究发现引入糖基化后 得到了稳定性优良的两株突变酶PGUS.P一35和 PGUS.P一259,65℃保温90 min时,二者剩余酶活 ・3676・ 化工学报 第66卷 :三 茗 。 专 兰 羔 羔 \五【^;0∞ AI 一 t1me/min time/min fb1 (a) time/min (c) 图9突变酶热稳定性分析 Fig.9 Thermostability analysis of mutant enzymes 力分别维持在95%和93%;而PGUS.P一26的热稳 定性无明显变化,推测可能与之前模拟的该位点氨 Glycosylation-independent targeting enhances enzyme delivery to lysosomes and decreases storage in mucopolysaccharidosis type VII 基酸的改变引起其结构的细微改变有关。此外,引 入糖基化后,PGUS.P一26、PGUS—P.35和PGUS.P 259 对底物甘草酸的亲和力均增加,催化效率分别提高 mice[J].Proceedings ofthe National Academy ofSciences ofthe United States ofAmerica,2004,101(9):3083—3088. [5]Han M,Wang X,Ding H,et a1.The role of N-glycosylation sites in the activiy,sttabiliy,and expressiton of the recombinant elastase 了30.1%,23.9%和12.6%。本研究初步探究糖基化 的位点对蛋白质结构以及催化特性的影响,推测位于 turn/loop区的糖链的添加可能会在一定程度上影响 到一些loop环的柔性,从而改变蛋白质结构的刚性。 References Skropeta D.The effect of individual N-glycans on enzyme activity[J]l Bioorganic&Medicinal Chem&try,2009,17(7):2645-2653. Stengel C,Newman S Day JM,TutillH J,ReedM J,PurohitA. Effects of mutations and glycosylations on STS activity:a expressed by Pichia pastoris[J].Enzyme and Microbial Technology, 2014,54:32—37. [6] Shi Yumei(石玉梅),Zheng Lei(郑磊),Li Juan(李娟)Research progress of glycosilation on protein stability[J】l Progress Modern Biomedicine(现代生物医学进展),2011,11(24):5190-5192. [7] Yasuda Ikeda S,Sakai H,Tsukuba L Okamoto K,Nishishita K, a1.Role ofN-glycosylation in cathepsin E[J]l European Journal f oBiochemisty,1999,266(r2):383—391. 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