分居三个月可以起诉离婚。我国公民依法享有离婚自由，夫妻双方如果分居问题造成感情破裂的，一方或者双方就可以以夫妻感情破裂为由向起诉离婚。审理后认定双方感情已经完全破裂，而且经调解已经没有和好可能的，会依法判决准予离婚。
一、分居时间可以算结婚时间吗
（一）不管分居多久，婚姻关系都不会自动失效的，只有离婚之后婚姻关系才会解除。
离婚的方式有两种，协议离婚和诉讼离婚，协议离婚只要双方协商一致，对财产、子女抚养等问题达成一致意见即可，诉讼离婚则需要证明夫妻感情已经破裂。
如果诉讼离婚的，分居满两年的可以准予离婚。如果协议离婚的，不用分居就可以离婚。
如果是分居的公民想要诉讼离婚，应该具体看分居的原因和分居的时间，即必须是因感情不和引起分居，还有就是要分居满二年。这两个条件，是分居引起离婚所必须同时具备的。
（二）长期分居是可以起诉离婚的理由
根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民提起离婚诉讼。人民审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（1）重婚或者与他人同居；
（2）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（3）有、吸毒等恶习屡教不改；
（4）因感情不和分居满二年；
（5）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
二、三年不在一起会自动解除婚姻吗
三年不在一起不会自动解除婚姻。法律对分居多久才可以离婚是没有规定，不论分居多长时间，如果双方都不提出离婚，婚姻不会自动解除的。如果双方因感情不和分居满两年的，可以认定夫妻感情破裂，夫妻感情破裂是判决双方离婚的唯一标准。
依据我国法律规定，夫妻双方可以直接办理离婚登记手续，如果双方对财产分割、子女抚养等达不成一致意见的，可起诉到离婚，一方可以双方因感情不和分居满两年为由，请求判决离婚。
三、分居一年属于自动解除婚姻吗
不是自动解除婚姻，婚姻关系不存在自动解除的情况，必须办理离婚手续。
在我国离婚有协议离婚和诉讼离婚这两种方式，只要没有办理离婚登记或者被依法判决离婚夫妻无论分居了多久都不算是自动离婚。
不过如果双方是因为感情不和分居的，且分居的时间已经满两年的，则起诉离婚时可以作为认定夫妻感情破裂的标志，调解无效的会判决离婚。
【本文关联的相关法律依据】
《民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民提起离婚诉讼。
人民审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
