有分居协议不可以出轨。因为双方仍然处于夫妻关系存续期间，若是双方因为感情不和分居满两年的，起诉离婚时经过人民调解无效的，应当判决离婚。
一、民法分居多长时间可以离婚
分居多长时间可以离婚，法律没有时间规定。一般情况下，分居两年，且满足如下情形可以办离婚：
1、双方就离婚达成一致，订立书面离婚协议，共同申请离婚登记，经过一个月左右冷静期，即可领取离婚证；
2、双方起诉离婚的，需证明双方感情破裂，经调解无效，即可判决离婚，且夫妻因感情不和而分居满两年属于法定的夫妻感情破裂情形。
综上所述，我国离婚方式只有协议离婚与诉讼离婚两种。
二、双方分居多长时间能离婚
离婚和分居时间之间没有必然联系，具体如下：
1、双方就离婚、子女抚养、财产分割等问题达成协议的，可以亲自携带身份证、户口簿、结婚证、离婚协议到一方常住户口所在地的婚姻登记机关办理离婚登记，即使不分居也可以离婚；
2、双方不能达成一致的，想离婚的一方可以到被告住所地起诉离婚，认为夫妻关系破裂的，判决离婚，感情不和分居两年是判断感情不和的情况之一。
《中华人民共和国民法典》规定，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民提起离婚诉讼。人民审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
1、重婚或者与他人同居；
2、实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
3、有、吸毒等恶习屡教不改；
4、因感情不和分居满二年；
5、其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。经人民判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
三、因家庭矛盾分居两年算自动离婚吗
不算。无论因为什么原因分居多久都不能自动离婚。
离婚的方式有两种，一种是夫妻双方协商一致，到民政局办理离婚手续；第二种是协商不成的，到起诉离婚。
法律规定因为感情不和分居满两年经调解无效的，应准予离婚。这里的分居两年需要满足以下三个条件：一是分居强调的是夫妻双方互不履行夫妻义务，二是分居的原因必须是感情破裂而分居，第三，因感情破裂而分居两年，经调解没有和好可能的。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》一千零四十三条
家庭应当树立优良家风，弘扬家庭美德，重视家庭文明建设。
夫妻应当互相忠实，互相尊重，互相关爱；家庭成员应当敬老爱幼，互相帮助，维护平等、和睦、文明的婚姻家庭关系。
《中华人民共和国刑法》第二百五十
有配偶而重婚的，或者明知他人有配偶而与之结婚的，处二年以下有期徒刑或者拘役。
