有限责任公司一般缴纳的有、城建税、教育附加税、地方教育附加税、印花税、个人所得税、企业所得税。根据行业性质的不同，可能还会涉及房产税、土地使用税等。税种一般由登记注册时，在税务局进行税种核定，公司可以在电子我准备局查看自己所有申报的主要税种。
有限责任公司是股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任，公司以其资产为限承担债务责任。有限责任公司的股东人数规定为五十人以下。股东认缴出资额，可以用货币出资，也可以用实物、知识产权、土地使用权等非货币财产出资。
有限责任公司有如下特点：
1、由股东共同制定公司章程，并确认全体认缴的出资额；
2、具有独特的名称、住址；
3、股东符合法定人数；
4、有限责任公司具有的其他特点。
企业纳税的流程如下：
1、一般情况下企业实行查账征收，针对成本费用核算不健全而能够正确核算收入的企业，核定征收方法是由税务机关对企业核定一个应税所得率，再乘以所得税税率得出应纳税额，这是按收入核定征收；按费用核定征收方法略。
2、所得税一般按季申报，年终5月31日前汇算清缴申报，这是所得税法规定的。也有按月申报的，比较少，有的税务机关要求房地产企业按月申报，主要目的是组织收入。根据当地税务机关信息化条件和要求，可以选择网上报或去大厅手工填表报。
3、“之前是在分公司，上面有总公司，是每季末总公司根据全集团的利润来计算所得税，再分配到各个分公司去交。而年终汇算清缴的时候，只由总公司统一做汇算清缴，分公司不管。”这是跨地区总分机构汇总缴纳企业所得税的计算方法，季末总公司要向各分公司提供分配表，按收入的35%、工资的35%、资产的30%比例计算并在当地预缴，年终由总公司汇算清缴。
4、平时按季缴纳所得税是叫做预缴，汇算清缴后，可以多退少补。预缴的比汇算清缴的实际应交数多，可以向税务机关提交抵退税申请，提供已缴税证明，填写抵退税申请表，税务机关审核后，会把税款退回企业或在下期应缴税款中予以抵缴。
法律依据
《中华人民共和国税收征收管理法》
第三条 税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行；法律授权规定的，依照制定的行规的规定执行。任何机关、单位和个人不得违反法律、行规的规定，擅自作出税收开征、停征以及减税、免税、退税、补税和其他同税收法律、行规相抵触的决定。
