1、分居三年的，如果双方是因感情不和而分居的，而且是连续分居三年的，那会判决离婚。因为夫妻因感情不和而分居满两年属于法定的夫妻感情破裂的情形。
2、法律依据：《民法典》
第一千零七十九条夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民提起离婚诉讼。
人民审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
一、解除婚姻关系的途径有哪些
在我国，解除婚姻关系的合法途径一般有三种：
1、到婚姻登记机关办理离婚，由登记机关收缴结婚证，颁发离婚证，结婚证或离婚证均是公民个人婚姻状态的法律凭证
2、由人民判决离婚，即通过诉讼途径解除当事人的婚姻关系
3、这是一种是非常态的，即婚姻一方当事人死亡或是被人民宣告死亡的，则婚姻关系自然终止。
另外，在分居的情况下，其实并不一定就只能通过诉讼方式离婚，若此时双方分居了一段时间之后，彼此同意解除婚姻关系，格外也就相关的事项协商达成了一致的话，那么通过协议方式也是可以最终解除婚姻关系的。
